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硫酸軟骨素是一種由D-葡萄糖醛酸和N-乙酰氨基半乳糖通過β- 1,4 - 糖苷鍵連接而成的重復二糖單元組成的多糖，其中N-乙酰氨基半乳糖的C-4位或C-6位羥基發生硫酸酯化。天然硫酸軟骨素多提取自哺乳動物氣管等軟骨，具有易吸濕、易溶于水、不溶于乙醇和丙酮等有機溶劑的性質，遇水容易膨脹形成黏漿，熱穩定性較差。
天然硫酸軟骨素主要來自豬、牛、雞、鯊魚的軟骨組織，硫酸軟骨素因化學結構不同又具有多種亞型，不同亞型的硫酸軟骨素在自然界中存在于不同的組織中，如透明質酸主要來自關節液、軟骨結締組織、皮膚、體液、角膜、雄雞冠等；硫酸軟骨素A主要來自骨、軟骨、角膜、皮膚血管等；硫酸軟骨素B主要來自皮膚、心瓣膜、豬胃黏膜、臍帶、韌帶、動脈等組織；硫酸軟骨素C主要存在于皮膚、心瓣膜、豬胃黏膜、動脈等組織；硫酸角質素主要存在于角膜、主動脈、軟骨、髓核等組織；肝素主要存在于肝、肺、脾、肌肉、動脈壁等組織；硫酸肝素主要提取自血管和細胞表面。
（1）用于冠心病治療
硫酸軟骨素具有澄清脂質的效果，以其為原料開發的保健食品和藥品已長期應用于防止冠心病、心絞痛、心肌梗死、冠狀動脈粥樣硬化、心肌缺血等疾病，臨床應用未發現其有明顯的毒副作用，能顯著降低冠心病患者的發病率和死亡率。
（2）改善關節問題
硫酸軟骨素與氨基葡萄糖聯合使用，能夠促進軟骨再生、軟化骨骼，臨床上作為常用的治療關節疾病的藥品，能夠有效改善關節問題。
（3）保護骨骼
硫酸軟骨素可以防止骨骼鈣化加劇，預防骨骼變硬變脆，促使僵硬的骨骼恢復柔韌性；另外，硫酸軟骨素還能在一定范圍內縮小變硬變脆呈現擴張狀態的骨骼輪廓，有效的改善骨質增生。
（4）促進角膜創傷的愈合及改善眼部干燥癥狀
硫酸軟骨素能夠改善角膜血液循環、加速新陳代謝、增強通透性、促進角膜基質中滲透液的吸收以及纖維的增長，消除炎癥，對角膜膠原纖維具有保護作用；其次，硫酸軟骨素能夠改善眼角 膜組織的水分代謝，促使角膜表面形成一層透氣保水膜，促進角膜創傷的愈合及改善眼部干燥癥狀。
1．硫酸軟骨素作為保健食品或保健藥品長期應用于防治冠心病、心絞痛、心肌梗死、冠狀動脈粥樣硬化、心肌缺血等疾病，無明顯的毒副作用，能顯著降低冠心病患者的發病率和死亡率。長期的臨床應用發現，在動脈和靜脈壁上沉積的脂肪等脂質可以被有效地去除或減少，能顯著降低血漿膽固醇，從而防止動脈粥樣硬化的形成。
2．硫酸軟骨素用于治療神經痛、神經性偏頭痛、關節痛、關節炎以及肩胛關節痛，腹腔手術后疼痛等。
3．預防和治療鏈霉素引起的聽覺障礙以及各種噪音引起的聽覺困難、耳鳴癥等，效果顯著。
4．對慢性腎炎、慢性肝炎、角膜炎以及角膜潰瘍等有輔助治療作用。
5．近年來報道，鯊魚軟骨中的軟骨素有抗腫瘤的作用。此外，硫酸軟骨素還應用于化妝品以及外傷傷口的愈合劑等。
6．硫酸軟骨素還用于滴眼劑。