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在當前的農藥市場上，乙氧氟草醚和乙羧氟草醚是兩種不同的除草劑，雖然只是一字之差，但二者除草及活性相關甚多，部分用戶在使用時易將二者誤以為同一化合物，那兩者到底有什么區別呢？
乙羧氟草醚和乙氧氟草醚均為二苯醚類除草劑，通過抑制原卟啉原氧化酶而起作用。前者主要登記用于大豆、花生、小麥、水稻等作物田莖葉處理防除闊葉雜草。后者主要用于土壤封閉處理，殺草譜較寬，對幼苗期雜草也有一定防效，登記用于大蒜、花生、棉花、夏大豆、夏玉米、移栽水稻、馬鈴薯、西瓜、姜、甘蔗等農作物田和林業苗圃、非耕地、蘋果園。
乙羧氟草醚主要用于莖葉處理防除已出闊葉雜草。植物吸收藥物后原卟啉原氧化酶受抑制，生成對植物細胞具有毒性的四吡咯，積聚而發生作用，可有效防除藜科、蓼科、莧菜、蒼耳、龍葵、馬齒莧、鴨跖草、大薊等多種闊葉雜草，具有作用速度快、活性高、不影響后茬作物等特點。該藥活性較高，低溫期用藥、用藥量過大或噴藥濃度過高時容易對作物產生藥害，特別是在作物幼苗弱小時施用，可能引起死苗。
乙氧氟草醚通過抑制原卟啉原氧化酶，在有光的情況下發揮殺草作用。藥物主要通過胚芽鞘、中胚軸進入植物體內，經根部吸收較少，并有極微量通過根部向上運輸進入葉部。芽前和芽后早期施用效果最好，對種子萌發的雜草除草譜較廣，能防除闊葉雜草、莎草和稗，對多年生雜草只有抑制作用。該藥水溶性極低，在土壤中的移動性較小。在水田施藥，藥物施入水層后24小時內沉降在土表，并很快吸附于0～3厘米表土層中，不易垂直向下移動，3周內被土壤中的微生物分解成二氧化碳，在土壤中半衰期為30天左右（大田半衰期5～55天，好氣土293天，嫌氣約580天）。該藥為觸殺型藥，噴藥時要均勻，施藥劑量要準。移栽稻田施用時，要求氣溫達20～30℃，氣溫低于20℃、土溫低于15℃時不能施用；要求秧苗健壯，苗高20厘米以上，秧齡30天以上，秧苗過小、嫩弱或遭傷害未恢復時不能施用；藥土法比噴霧法安全，在露水干后施藥；施藥田應整平，保持水層，水層不能淹沒水稻心葉，不要在暴雨來臨前施藥，施藥后遇暴雨田間水層過深，需排水保持淺水層。該藥活性高，用量少，使用不當容易對水稻、大豆產生藥害。
1. 乙羧氟草醚只有觸殺活性，沒有封閉活性（或者說殘效期很短），乙氧氟草醚有觸殺活性也有封閉作用（半衰期較長）；
2. 乙氧氟草醚苗后殺草活性比乙羧氟草醚低很多，所以主要是用于封閉；
3. 乙羧氟草醚由于殘效期短，殺草譜較寬特別是對于抗草甘膦的惡性雜草鐵莧菜效果優異，所以在很多地方可以作為草甘膦的助劑使用；
4. 乙氧氟草醚使用后很多作物不能直播（殘效期）所以作為乙羧氟草醚用途略顯不合適。但是如果推廣一封一殺也是有點的，看操作；
5. 共同點：都是在有光照的情況下發揮作用。