69075-47-4 / 5-乙炔基-2′-脫氧胞苷的制備

概述^[1]

5-乙炔基-2'-脫氧胞苷是一種有機中間體，可由5-碘-2'-脫氧胞苷與三甲基硅基炔偶聯得到。

制備^[1]

將5-碘-2'-脫氧胞苷（1.97g，5.58mmol）的無水DMF（37mL）和無水三乙胺（19mL）溶液脫氣并在室溫下攪拌。加入三甲基甲硅烷基乙炔（4.4g，44.6mmol），Pd（PPh₃）₂Cl₂（392mg，0.558mmol）和CuI（106mg，0.558mmol），并將混合物攪拌1小時。將混合物減壓濃縮，并將殘余物與二甲苯（2×30mL）共蒸發，并通過快速柱色譜法（0-20％MeOH的CH₂Cl₂溶液）純化，得到粗TMS-保護的中間體（2.39g）。像白色泡沫。將粗中間體溶于24％氨水溶液（40mL）中，并將混合物在室溫下攪拌2小時。將混合物減壓濃縮，并將殘余物與99％乙醇（50mL）共蒸發，并通過快速柱色譜法（0-30％MeOH的CH₂Cl₂溶液）純化得5-乙炔基-2'-脫氧胞苷（1.33g，95％），為白色固體。

Rf 0.2（20％MeOH的CH₂Cl₂溶液）。 ¹H NMR（200MHz，DMSO-d 6）δ8.25（s，1H，H-60），7.69（s，1H，NH），6.81（s，1H，NH），6.09（t，J = 6.4Hz， 1H，H-1'），5.21（d，J = 2.8Hz，1H，3'-OH），5.09（t，J = 4.4Hz，1H，5'-OH），4.33（s，HC。 C，1H），4.20（m，1H，H-3'），3.79（q，J = 3.2Hz，1H，H-4'），3.65-3.51（m，2H，H-5'），2.16（ m，1H，H-2'），1.99（m，1H，H-2'）。 ¹³C NMR（100MHz DMSO-d 6）δ164.2,153.4,145.4,88.8,87.5,85.8,85.4,75.9,70.0,60.9,40.9。 HRESI-MS：m / z 274.0790 [M + Na]⁺計算值C 11 H 13 N 3 O 4·Na⁺ 274.0799。

主要參考資料

[1] Andersen N K , D Ssing H , Jensen F , et al. Duplex and Triplex Formation of Mixed Pyrimidine Oligonucleotides with Stacking of Phenyl-triazole Moieties in the Major Groove[J]. JOURNAL OF ORGANIC CHEMISTRY, 2011, 76(15):6177-6187.