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951-78-0 / 2′-脫氧鳥苷的制備

背景及概述[1][2]

核苷及其衍生物在抗病毒和抗腫瘤方面的作用近年來(lái)越來(lái)越引起人們的關(guān)注。 1992 年 C .Perigaud 等人對(duì)核苷類抗病毒藥物進(jìn)行了綜述。2′ -脫氧鳥苷是合成寡脫氧核苷酸等多種抗病毒 、抗腫瘤核酸藥物的重要原料,在市場(chǎng)上有廣泛需求。脫氧鳥苷很難用化學(xué)合成法進(jìn)行合成,到現(xiàn)在為止仍沒(méi)有成熟的化學(xué)合成脫氧鳥苷方法的報(bào)道。

現(xiàn)在獲得脫氧鳥苷的方法主要是采用以 DNA為原料,先用核酸酶水解生成脫氧核苷酸,然后再用磷酸單酯酶水解,使其生成脫氧核苷,此方法成本高,而且 DNA 來(lái)源有限,大規(guī)模生產(chǎn)會(huì)受到限制。關(guān)于酶法合成脫氧鳥苷的報(bào)道,日本橫關(guān)鍵三等應(yīng)用肺炎克雷伯氏菌( K lebsiella pneumoni -ae) 生成脫氧鳥苷的方法,但轉(zhuǎn)化率僅為28 %。

使用產(chǎn)氣腸桿菌為酶源,以 2 ′ -脫氧尿苷和鳥苷為底物,2 ′ -脫氧鳥苷轉(zhuǎn)化率僅為 18 %。其它亦有用胸苷和 2,6-二氨基嘌呤生成 2,6-二氨基 2′ -脫氧核苷,再用腺苷脫氨酶處理得到脫氧鳥苷的方法,但工藝步驟多,成本較高。

應(yīng)用[2-3]

2'-脫氧鳥苷是一種天然的脫氧核苷,可直接用于制備組合脫氧核苷藥物或者作為化學(xué)試劑用于生化研究;同時(shí)可作為中間體用于合成一些抗病毒核苷類藥物以及分子標(biāo)記物,如以2’-脫氧鳥苷原 料合成8-溴-2’-脫氧鳥苷和8-羥基-2’-脫氧鳥苷等重要分子標(biāo)記物;合成2’-脫氧鳥苷的6位衍生物,如6-甲氧基、6-氨基等系列重要抗腫瘤的2’-脫氧鳥 苷衍生物。

另外采用2’-脫氧鳥苷為原料合成致癌或抗癌過(guò)程中的重要分子標(biāo)記物N7-鳥嘌呤烷化物,該方法是以2′-脫氧鳥苷為原料,以碘乙烷、環(huán)氧乙烷、1-溴-2-氯乙烷、3-溴丙烯或1,2-二溴乙烷作為烷化劑,在二甲基亞砜、冰醋酸或二甲基乙酰胺溶液中,于15~50℃,反應(yīng)0.5~96h,反應(yīng)完畢后進(jìn)行減壓蒸餾,粗產(chǎn)品經(jīng)硅膠柱層析分離純化,用乙酸乙酯∶石油醚(體積比)=10~20∶1和乙酸乙酯∶無(wú)水甲醇(體積比)=10~20∶1洗脫液分別洗脫,得到N7-鳥嘌呤烷化物。方法具有反應(yīng)條件溫和、分離純化過(guò)程簡(jiǎn)單、產(chǎn)物收率高、對(duì)環(huán)境污染較少等優(yōu)點(diǎn),有利于N7-鳥嘌呤烷化物的大量生產(chǎn)。

制備[2-4]

方法1:利用產(chǎn)核苷磷酸化酶的乙酰短桿菌細(xì)胞酶法合成 2′ -脫氧鳥苷,其可能的反應(yīng)機(jī)理如圖 1所示:

2'-脫氧鳥苷的制備

以脫氧胸腺嘧啶核苷( Thymidine,dTR) 為脫氧核糖的供體,鳥苷酸(GM P) 為堿基鳥嘌呤的供體,在核苷磷酸化酶的作用下合成脫氧鳥苷。該實(shí)驗(yàn)還優(yōu)化了其酶反應(yīng)條件,從而得到 56.4 %的胸苷轉(zhuǎn)化率,并使用離子交換法分離得到了純度90.2 %的脫氧鳥苷。它具有步驟簡(jiǎn)單,反應(yīng)時(shí)間較短,產(chǎn)物分離比較容易等優(yōu)點(diǎn)。具體步驟如下:

1)乙酰短桿菌的培養(yǎng)和濕菌體制備:在1 L的帶擋板的錐形瓶中裝入發(fā)酵培養(yǎng)基 200 mL,于 121 ℃滅菌 20 min,冷卻后從新鮮、長(zhǎng)勢(shì)良好的乙酰短桿菌斜面上接種,36 ℃培養(yǎng) 16 h,然后將培養(yǎng)液 10 000 r/min 離心 10 min,棄去上清液,所得菌體用 30 mm ol/ L 磷酸鹽緩沖液( pH 7.0)洗滌2 ~ 3次,作為酶源冷凍備用。

2)脫氧鳥苷酶法合成及工藝優(yōu)化:20mmol/L 的脫氧胸腺嘧啶核苷( dTR),20 mm ol/ L的鳥苷酸 (GMP ),5 % 的濕菌體,100 m L30 mmol/L pH 6.98 磷酸鹽緩沖液作為標(biāo)準(zhǔn)反應(yīng)混合物,在60 ℃的恒溫水浴槽中攪拌反應(yīng),反應(yīng)時(shí)間為 6h。在不改變其它條件的情況下,依次考察不同的反應(yīng)溫度、菌體量、反應(yīng) pH、磷酸鹽緩沖液濃度、底物濃度、底物比率和反應(yīng)時(shí)間對(duì)酶反應(yīng)的影響,優(yōu)化其反應(yīng)條件。

3)酶反應(yīng)液中脫氧鳥苷的分離純化:取適量的脫氧鳥苷反應(yīng)液,高溫滅活后用硅藻土過(guò)濾,在其中加入 5 mmol/L 的四硼酸鈉,再通過(guò) pH 中性的氯型陰離子樹脂進(jìn)行分離,以 0.5 倍柱體積每小時(shí)的流速上樣洗脫,上樣結(jié)束后用 0 ~ 0.2 mol/L的 NaCl 進(jìn)行梯度洗脫,分布收集洗脫液。取收集到的脫氧鳥苷洗脫液脫鹽濃縮結(jié)晶,得到脫氧鳥苷樣品。

方法2:一種核苷類藥物中間體2’-脫氧鳥苷的生產(chǎn)方法,是采用產(chǎn)脫氧核苷核糖轉(zhuǎn)移酶 的發(fā)酵乳桿菌CGMCC 1.1880菌體漿狀物為生物催化劑,在聚乙二醇(PEG)/無(wú)機(jī)鹽雙水相轉(zhuǎn)化體系,以β-胸苷和鳥嘌呤為原料進(jìn)行酶促反應(yīng),最后獲得2’-脫氧鳥苷。所述的雙水相轉(zhuǎn)化體系中所用多聚物為聚乙二醇,所選的種類有PEG4000、 PEG8000、PEG10000、PEG15000和PEG20000。其優(yōu)選為PEG10000和PEG15000,其最優(yōu)選為 PEG10000。

所述聚乙二醇的濃度為25g/L-55g/L,包括 25g/L、45g/L和55g/L,優(yōu)選 PEG10000的的濃度為45g/L。雙水相轉(zhuǎn)化體系中所用無(wú)機(jī)鹽為磷酸鹽,所選的鹽種類有磷酸二氫鉀、磷酸二氫鈉和磷酸二氫銨,優(yōu)選為磷酸二氫鉀。磷酸鹽的濃度為30g/L-60g/L,包括30g/L、 45g/L和60g/L,優(yōu)選磷酸二氫鉀的濃度為45g/L。底物為β-胸苷和鳥嘌呤,其中β-胸苷濃度為16.5g/L,鳥嘌呤所選的濃度為10.3g/L-18.0g/L,包括10.3g/L、15.2g/L和18.0g/L,優(yōu)選濃度為15.2g/L;β-胸苷和鳥嘌呤摩爾比為1:1-2,包括1:1、1:1.5和1:2,優(yōu)選的比例為1:1.5。

β-胸苷是目前五種脫氧核苷(2’-脫氧腺苷、2’-脫氧尿苷、2’-脫氧胞苷、2’-脫氧 鳥苷和β-胸苷)中最易得、價(jià)廉的脫氧糖基供體,而鳥嘌呤相比于其它含鳥嘌呤結(jié)構(gòu)的物質(zhì),如鳥苷、鳥苷酸或者2,6-二氨基嘌呤等,是最為直接、易得和價(jià)廉的脫氧核糖受體,因此,采用生物催化法制備2’-脫氧鳥苷,鳥嘌呤和β-胸苷作為初始底物是最理想的組合。

方法3:一種用乙酰短桿菌的核苷磷酸化酶合成2’-脫氧鳥苷的方法,包括如下步驟:

(1)將乙酰短桿菌(Brevibacteriumacetylicum)QD96-CGMCCNo.0472接入培養(yǎng)基進(jìn)行培養(yǎng),培養(yǎng)獲得的菌體作為核苷酸磷酸化酶?jìng)溆茫凰雠囵B(yǎng)基為常規(guī)的,其組分和重量含量包括:牛肉膏1%,蛋白胨1%,酵母膏0.5%,NaCl0.5%,pH為7.0;

(2)然后將步驟(1)獲得的菌體加入底物溶液,所述底物溶液中,脫氧核糖受體的含量為5~40mol/L,脫氧核糖供體濃度為5~40mol/L,磷酸緩沖液濃度為10~50mmol/L,菌體的濕重加入重量為1~5%,40~65℃反應(yīng)1~4h,離心,獲得溶液含有2’-脫氧鳥苷的溶液,溶液經(jīng)HPLC檢測(cè),2’-脫氧鳥苷的轉(zhuǎn)化率達(dá)60%,然后從反應(yīng)產(chǎn)物中收集2’-脫氧鳥苷;所述的脫氧核糖受體選自鳥嘌呤、鳥苷或鳥苷酸,但由于鳥嘌呤在水中溶解度較低,其中以鳥苷酸為最佳;所述的脫氧核糖供體選自2’-脫氧核糖、2’-脫氧核糖-1-磷酸,胸苷、2’-脫氧尿苷或2’-脫氧胞苷等,但從目前原料來(lái)源難易和價(jià)格因素考慮,選擇胸苷、2’-脫氧尿苷或脫氧核糖較好。

主要參考資料

[1] 李喻, 竇潔, 曹靜, 邱蔚然, & 周長(zhǎng)林. (2011). 乙酰短桿菌酶法合成 2′-脫氧鳥苷.藥物生物技術(shù),18(2), 119-123.

[2] CN201510140553.1一種核苷類藥物中間體2’-脫氧鳥苷的生產(chǎn)方法

[3] CN201110114010.4N7-鳥嘌呤烷化物的制備方法

[4] CN201010611733.0用乙酰短桿菌的核苷磷酸化酶合成2’-脫氧鳥苷的方法

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